Hadoop学习

发布 2020-08-23
更新 2020-08-23
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Hadoop

安装

Docker Install

echo -e "===prepare workspace==="
if [ ! -d "workspace" ]; then
echo "create new workspace"
mkdir workspace
fi
cd workspace

echo -e "===goto current space==="
version=$[$(ls | sort -n | tail -n 1)+1]
mkdir $version
cd $version
echo "Version: $version"
echo "Space: $(pwd)"

cp ../../Dockerfile Dockerfile

cat>core-site.xml<<EOF
<configuration>
    <property>
        <name>fs.defaultFS</name>
        <value>hdfs://localhost:9000</value>
    </property>
    <property>
        <name>hadoop.tmp.dir</name>
        <value>/data/hadoop</value>
    </property>
</configuration>
EOF

cat>mapred-site.xml<<EOF
<configuration>
    <property>
        <name>mapreduce.framework.name</name>
        <value>yarn</value>
    </property>
    <property>
        <name>mapreduce.application.classpath</name>
        <value>\$HADOOP_MAPRED_HOME/share/hadoop/mapreduce/*:\$HADOOP_MAPRED_HOME/share/hadoop/mapreduce/lib/*</value>
    </property>
</configuration>
EOF

cat>yarn-site.xml<<EOF
<configuration>
    <property>
        <name>yarn.nodemanager.aux-services</name>
        <value>mapreduce_shuffle</value>
    </property>
    <property>
        <name>yarn.nodemanager.env-whitelist</name>
        <value>JAVA_HOME,HADOOP_COMMON_HOME,HADOOP_HDFS_HOME,HADOOP_CONF_DIR,CLASSPATH_PREPEND_DISTCACHE,HADOOP_YARN_HOME,HADOOP_MAPRED_HOME</value>
    </property>
    <property>
        <name>yarn.resourcemanager.address</name>
        <value>localhost:8032</value>
      </property>
      <property>
        <name>yarn.resourcemanager.scheduler.address</name>
        <value>localhost:8030</value>
      </property>
      <property>
        <name>yarn.resourcemanager.resource-tracker.address</name>
        <value>localhost:8031</value>
      </property>
</configuration>
EOF

cat>entrypoint.sh<<EOF
/usr/sbin/sshd
if [ ! -d "/data/hadoop" ]; then
hdfs namenode -format
fi
hdfs --daemon start datanode
hdfs --daemon start namenode
\$HADOOP_HOME/sbin/start-yarn.sh
echo "done!"
while true; do sleep 30; done;
EOF

docker build -t hadoop:$version .

docker rm -f hadoop || true
docker run -idt --rm \
  -p 9870:9870 \
  -p 8088:8088 \
  -v /data/hadoop:/data \
  --name hadoop \
  hadoop:$version
docker logs hadoop -f

FROM centos:centos8

# install ssh
RUN \
yum install openssh-server openssh-clients passwd  -y; \
sed -i "s/^UsePAM yes/UsePAM no/g" /etc/ssh/sshd_config; \
echo 123456 | passwd root --stdin; \
ssh-keygen -t rsa -P '' -f ~/.ssh/id_rsa; \
cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys; \
chmod 0600 ~/.ssh/authorized_keys; \
ssh-keygen -q -N "" -t rsa -f /etc/ssh/ssh_host_rsa_key; \
ssh-keygen -q -N "" -t ecdsa -f /etc/ssh/ssh_host_ecdsa_key; \
ssh-keygen -q -N "" -t ed25519 -f /etc/ssh/ssh_host_ed25519_key;

# install java
RUN \
yum install wget -y; \
wget https://download.java.net/java/early_access/jdk16/27/GPL/openjdk-16-ea+27_linux-x64_bin.tar.gz ;\
tar -zxf openjdk-16-ea+27_linux-x64_bin.tar.gz -C /usr/local/; 

# env java
ENV JAVA_HOME /usr/local/jdk-16
ENV PATH $PATH:$JAVA_HOME/bin

# install hadoop
RUN \
yum install wget -y; \
wget https://mirror.bit.edu.cn/apache/hadoop/common/hadoop-3.3.0/hadoop-3.3.0.tar.gz; \
tar -zxf hadoop-3.3.0.tar.gz -C /usr/local/; 

# env hadoop
ENV HADOOP_MAPRED_HOME /usr/local/hadoop-3.3.0
ENV HADOOP_HOME /usr/local/hadoop-3.3.0
ENV PATH $PATH:$HADOOP_HOME/bin
ENV HDFS_NAMENODE_USER root
ENV HDFS_DATANODE_USER root
ENV HDFS_SECONDARYNAMENODE_USER root
ENV YARN_RESOURCEMANAGER_USER root
ENV YARN_NODEMANAGER_USER root

RUN \
sed '1 iexport JAVA_HOME=/usr/local/jdk-16' \
    -i $HADOOP_HOME/etc/hadoop/hadoop-env.sh; \
sed '1 iexport HADOOP_HOME=/usr/local/hadoop-3.3.0' \
    -i $HADOOP_HOME/etc/hadoop/hadoop-env.sh;
COPY core-site.xml $HADOOP_HOME/etc/hadoop/core-site.xml
COPY mapred-site.xml $HADOOP_HOME/etc/hadoop/mapred-site.xml
COPY yarn-site.xml $HADOOP_HOME/etc/hadoop/yarn-site.xml
COPY entrypoint.sh /entrypoint.sh

CMD ["sh", "/entrypoint.sh"]

K8S Install

cd .
mkdir hadoop || true
cd hadoop

cat>hadoop-deployment.yaml<<EOF
apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: hadoop-deployment
  labels:
    app: hadoop
spec:
  replicas: 1
  selector:
    matchLabels:
      app: hadoop
  template:
    metadata:
      labels:
        app: hadoop
    spec:
      containers:
      - name: hadoop
        image: sequenceiq/hadoop-docker:latest
        command: ["/etc/bootstrap.sh"]
        args: ["-d"]
        ports:
        - containerPort: 50070
EOF

cat>hadoop-service.yaml<<EOF
apiVersion: v1
kind: Service
metadata:
  name: hadoop-service
spec:
  type: NodePort
  selector:
    app: hadoop
  ports:
    - port: 50070
      targetPort: 50070
      nodePort: 30000
EOF

kubectl apply -f hadoop-deployment.yaml
kubectl apply -f hadoop-service.yaml

Hadoop概述

优点

高可靠
高拓展
高效性
高容错

HDFS

HDFS是分布式文件系统，包含NameNode, DataNode和Secondary NameNode

组件	功能
NameNode	储存文件的元数据
DataNode	储存文件块，校验和
Secondary NameNode	协助NameNode处理元数据

YARN

YARN是分布式资源调度器，包含了ResourceManager, NodeManager, ApplicationMaster, Container

组件	功能
ResourceManager	处理客户端请求，监控NodeManager, 启动ApplicationMaster, 分配和调度资源
NodeManager	管理单个节点上的资源，处理ResourceManager和ApplicationMaster的命令
ApplicationMaster	切分数据，为应用程序申请资源，并分配给任务，处理任务的监控和容错
Container	代表节点的CPU,内存，磁盘，网络

MapReduce

MapReduce是一个计算模型， Map阶段并行处理数据，Reduce阶段对Map汇总

HDFS

HDFS全称为Hadoop Distributed File System,适用于一次写入，多次读出，不支持修改

Block

文件分块存储，默认是128M，block的寻址时间一般为10ms，寻址时间为传输时间的1%的时候，达到最佳状态，机械硬盘的速率是100M/s, 所以文件分块的大小为100M 较佳，近似到128M.
$$
10ms / 1% \to 1s\
1s / 100MB/s \to 100MB \
100MB \to 128MB
$$

block太小增加寻址时间，太大会导致数据传输的时间过长，所以block的大小取决于磁盘的传输速率

HDFS shell

https://hadoop.apache.org/docs/current/hadoop-project-dist/hadoop-common/FileSystemShell.html

HDFS读写文件

NameNode工作机制

NameNode将内存数据持久化到磁盘中，分为fsimage和edits两个文件，fsimage是老的内存镜像，edits是追加格式的日志，表示着内存的变化情况，随着NameNode工作，edits会越来越大，这时候SecondaryNameNode会协助NameNode将edits与fsimage合并为新的fsimage。注意下图紫色部分的流程即可

集群安全模式

当NameNode不是第一次启动的时候，会加载Fsimage，并执行Edits日志，最后合并，此后开始监听DataNode请求，这个过程中NameNode一直是安全模式，文件系统处于只读状态，如果满足最小副本数，NameNode会在30秒后退出安全模式

NameNode多目录配置

<property>
    <name>dfs.namenode.name.dir</name>
    <value>file:///xxx,file:///xxx</value>
</property>

当我们配置了多个目录以后， NameNode的数据会同时存储在这些目录中，这些目录中的内容是一样的，如果一个目录损坏，NameNode会通过另一个目录恢复

DataNode工作机制

超时时间是2 * dfs.namenode.heartbeat.recheck-interval + 10 * dfs.hertbeat.interval

MapReduce

全过程

(input) <k1, v1> -> map -> <k2, v2> -> combine -> <k2, v2> -> reduce -> <k3, v3> (output)

InputFormat

InputFormat是执行MapReduce的第一步，他主要用于在从HDFS文件系统输入到MapTask的过程

名词	解释
数据块	Block是HDFS物理上把数据分成的多块
数据切片	Split是逻辑上对数据的分片，每个Split由一个MapTask处理

切片方法	备注
TextInputFormat	按照大小切片，kv分别是行偏移量和行的具体数据
KeyValueTextInputFormat	按照大小切片，kv是每一行由分隔符分割的左右两部分
NLineInputFormat	按照行数切片，kv分别是行偏移量和行的具体数据
CombineTextInputFormat	按照大小拆分大文件，合并小文件，kv分别是行偏移量和行的具体数据

Map

当经过了InputFormat以后，数据就进入到了Map阶段，

在这个阶段，Map框架会对每一对KV进行并行处理，并输出为新的KV，

把新的KV写入环形缓冲区，一端写索引，另一端写数据，

直到环形缓冲区达到80%(80MB)，Map框架将缓冲区数据排序并写入磁盘文件进行分区

直到文件数量达到一定上限，Map框架将文件排序合并，并进行分区

Partition

Map后，需要将数据写入不同的分区，

ReduceTask数大于分区数，则最后几个Reduce为空
ReduceTask小于分区数大于1，则异常
ReduceTask=1，则只有一个输出文件

默认的分区是HashPartitioner

MapReduce中的排序

MapReduce两个阶段都会进行排序，不管实际是否需要

Map：环形缓冲区 -> 达到80% -> 快排 -> 写入文件 -> Map完成 -> 所有文件归并排序
Reduce：远程拷贝文件到内存-> 达到内存阈值-> 写入一个磁盘文件-> 磁盘文件个数达到阈值-> 合并文件 -> 拷贝完成-> 所有数据(磁盘+内存)归并排序

排序的方法

部分排序：输出是多个文件，保证每个文件有序
全排序：输出是一个文件，保证这个文件有序
辅助排序：
二次排序：排序中有两个判断条件

如何排序

实现WriteableCompable接口即可

Combiner

Combiner就是一个局部的Reduce，他不一定必要，并不通用于所有的MR程序，比如求平均值，但是在局部Reduce不影响全局Reduce的情况下它可以降低网络传输压力

1	job.setCombinerClass(IntSumReducer.class);

Shuffle

往往我们称Map之后，Reduce之前的操作为Shuffle

Reduce

OutputFormat

OUTPUTFORMAT	描述
TextOutputFormat	把结果写成文本行
SequenceFileOutputFormat	写成二进制文件

Join

在Reduce端Join：用同一个key即可

在Map端Join：用字典手动Join

Compress

支持gzip,bzip,Lzo等压缩方式，可以用于输入文件的解压缩，输出文件的压缩，mapreduce中间文件的压缩

Map端压缩

1
2
3

configuration.setBoolean("mapreduce.map.output.compress",true);
configuration.setClass("mapreduce.map.output.compress.codec",
                          BZip2Codec.class, CompressionCodec.class)

Reduce压缩

1 2	FileOutputFormat.setCompressOutput(job,true); FileOutputormat.setOutputCompressorClass(job,GzipCodec.class);

MR速度慢的原因

计算机性能： CPU、内存、磁盘、网络

IO: 数据倾斜，小文件多，不可分块的超大文件多，spill次数多，merge次数多

MR优化

输入阶段：合并小文件
Maper阶段：调整环形缓冲区大小和溢写比例
Maper阶段：调整合并文件的文件个数阈值
Maper阶段：使用Combiner
Reduce阶段：合理设置Map Reduce个数
Reduce阶段：调整slowstart.completedmaps,提前申请Reduce资源
Reduce阶段：MapTask机器文件 -> ReduceTask机器Buffer -> 磁盘 -> Reduce, 调整Buffer，让Buffer中保留一定的数据，直接传给Reduce
压缩数据
开启JVM重用

Yarn

流程

调度器

FIFIO调度器：先进先出
容量调度器（默认）：支持多个队列，每个队列有一定的资源，各自采用FIFO，对同一个用户的作业所占资源进行限制，安装任务和资源比例分配新的任务，按照任务优先级、提交时间、用户的资源限制、内存限制对队列中的任务排序
公平调度器（并发度非常高）：多个队列，每个队列中的job可以并发运行，可以每个job都有资源，哪个job还缺的资源最多，就给哪个job分配资源

任务推测执行

当前Job已完成的Task达到5%，且某任务执行较慢，则开始备份任务
$$
当前任务完成时刻 = 当前时刻 +（当前时刻 - 任务开始时刻）/ 任务运行进度\
备份任务完成时刻 = 当前时刻 + 所有任务平均花费时间
$$
每个任务最多一个备份任务，每个作业也有备份任务上限

HA

HDFS HA

YARN HA

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